企业自主申报重点群体退税补贴的难点主要体现在以下几个方面：
一、政策理解与把握
1. 政策复杂多变：重点群体退税补贴政策涉及众多法规和条款，政策内容复杂且更新频繁。对于非税务专业人士来说，准确理解和把握政策内容并非易事，可能导致企业在申报过程中出现偏差，从而错失补贴或面临法律风险。
2. 细节要求严格：政策中对于重点人群的定义、申报条件、所需材料等都有严格的要求。企业需要详细了解这些具体细节，否则可能因不符合要求而被拒绝。
二、人员筛查与信息管理
1. 重点人群筛查难度大：企业需要准确判断哪些员工属于重点群体范围，这涉及到对员工个人信息的详细核查和比对。由于员工数量众多且流动性大，筛查工作量大且易出错。尤其是脱贫人口的证明，企业需要每三个月更新一次，意味着每三个月就要动员员工回他们的户籍所在地重新开一次证明，这对于企业和员工来说都需付出巨大的成本。
2. 信息更新与维护：重点人群的信息可能随时间发生变化，如就业状态、社保缴纳情况等。比如企业如果有新增或者离职的员工，如果已经离职，企业需要在给离职员工停缴社保的当月从名单中剔除。如果有入职符合重点群体的员工，则需要重新整理该名员工的材料及证明新增到次月的税期。无论如何，企业都需要定期更新和维护这些信息，以确保申报的准确性和合规性。
三、申报流程与材料准备
1. 申报流程繁琐：申报重点群体退税补贴涉及多个部门和环节，企业需要按照规定的流程逐步进行。流程繁琐且易出错，可能导致申报失败或延误。
2. 材料准备复杂：申报所需材料种类繁多且要求严格，包括员工的个人信息、劳动合同、社保缴纳证明等。企业需要花费大量时间和精力准备这些材料，并确保其真实性和完整性。
四、税务风险与合规性
1. 税务风险高：如果企业在申报过程中存在虚假申报、伪造材料等行为，将面临严重的税务风险。不仅会被取消补贴资格，还可能面临罚款甚至刑事责任。
2. 合规性要求高：企业需要确保申报过程符合相关税收法规和政策要求，避免因违规操作而引发税务问题。合规性要求企业具备较高的税务管理水平和风险防控能力。
五、时间压力与效率问题
1. 申报时间有限：重点群体退税补贴的申报时间通常有限制，企业需要在规定的时间内完成申报工作。时间压力可能导致企业匆忙申报，增加出错的风险。
2. 申报效率低：由于申报流程繁琐和材料准备复杂，企业自主申报的效率往往较低。这不仅增加了企业的成本负担，还可能影响企业的正常经营和发展。
综上所述，企业自主申报重点群体退税补贴的难点主要体现在政策理解与把握、人员筛查与信息管理、申报流程与材料准备、税务风险与合规性以及时间压力与效率问题等方面。为了克服这些难点，企业可以积极参加政策宣讲会、咨询专业税务顾问、建立标准化的材料准备流程、加强与税务机关的沟通等措施来提高申报的准确性和效率。同时，企业也可以考虑委托专业的第三方机构进行申报工作以降低风险和成本。
